Salah satu kurikulum utama dalam Program Kesantrian IAIN Manado adalah Ta'liim al-Qur'an. Menyadari pentingnya mengajarkan bacaan al-Qur'an dengan benar sesuai kaidah tajwid sebagaimana Rasulullah SAW. membaca al-Qur'an di masa hidup beliau, Program Kesantrian IAIN Manado melatih para ustadz(ah) yang terlibat dalam proses pengajaran al-Qur'an untuk membaca al-Qur'an dengan benar pada hari . Adalah beresiko mengajarkan cara baca al-Qur'an dengan cara yang tidak tepat karena bukan hanya tulisan ayat-ayat al-Qur'an yang wajib dipertahankan keasliaannya sebagaimana diturunkan kepada Rasulullah SAW dulu, tetapi cara bacanya pun wajib untuk dipelihara. | 
